【求助】内参的Ct值高于目的基因的Ct值说明什么?


新手做qRT-PCR,迂到困难,请各位战友不吝赐教,不胜感谢!
质粒转染细胞后提取总RNA,反转录得到cDNA做模板,SYBR green法定量PCR,但发现内参(beta-actin)的Ct值高于目的基因的Ct。即目的基因先于内参达到平台期。
看了好多文献,内参都是先于目的基因达到平台期的。我却得到这样的实验结果,是不是哪里出问题了?还是本来就存在这种可能性?这是不是说明模板中目的基因含量比内参含量还高?可不可以认为目的基因在细胞中表达比较高?

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最新回复

  • youyou99 (2016-3-03 16:56:55)

    有这种可能的,如果你的目的基因本身的表达量非常高的话,会出现这种情况的。
  • woshi (2016-3-03 16:57:13)

    但还有些疑惑,为什么没见过别的文献出现这样的情况呢?另外我的这个目的基因蛋白表达(相同的条件转染细胞提取蛋白做WB)却不高。是不是有点矛盾?
    有没有可能内参引物有问题(-20放了两年多了)?但已做过普通PCR,扩出的条带很好。
    有没有战友的实验出现过这样的结果?
  • nn255 (2016-3-03 16:57:27)


    你把cDNA稀释10倍,100倍再作下看看。
  • woshituzhu (2016-3-03 16:57:48)

    我用Trizol 法提取的细胞总RNA,有没有可能提总RNA过程中将细胞中的质粒DNA一起提出来?这样的话倒是可以解释目的基因CT值小于内参。
    对Trizol提RNA的原理不清楚,还请高手指点,不胜感谢!
  • woshituzhu (2016-3-03 16:59:25)

    把cDNA稀释10倍,100倍后得到的结果依旧类似:
    稀释10倍目的基因CT值:12.679
    beta-actin CT值:19.128
    稀释100倍目的基因CT值:15.899
    beta-actin CT值:22.255
    该怎样解释啊?困惑ing....................
  • wiwi (2016-3-03 16:59:40)


    Did you use Dnase to treat the sample?
  • woshi (2016-3-03 16:59:55)

    我没有用DNAase,在园子里搜了一下,发现有的战友提倡用,有的不提倡。
    用过的战友可否提供点经验?
    1.DNAase(RNAase free)购买哪个公司的产品好?除去DNAase外还要订别的试剂吗?因为在园子里看到还要用人胎盘RNA酶抑制剂,不用可不可以?
    2.DNAase处理的具体操作步骤?
    3.最后RNA大约会损失多少?
  • tuuu2 (2016-3-03 17:00:12)


    我有两个基因的定量也遇到类似情况,但不是所有的样本表达量都高,但计算ΔCt值的时候应该怎么办呢?
  • hulu呼噜 (2016-3-03 17:00:29)


    我也是这样情况,内参的Ct值高于目的基因的Ct值,是最近做实验遇到的,计算数据怎么办啊。。。好困惑@- @
  • yhtfyl (2023-2-24 07:36:59)

    感谢楼主分享,受教了
  • yhtfyl (2023-2-24 07:37:18)

    感谢楼主分享,受教了