【求助】7.5KD蛋白Western blot 怎么办?

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【求助】7.5KD蛋白Western blot 怎么办?
大家好:
我初次做试验就碰到一个难题:蛋白分子量只有7.5KD大。
做了十多次都没有成功,是哪个地方出了问题???
做的好累了,谢谢好心的XDJM
下面是我的试验步骤::
Western blotting 的方法步骤
第一天:
脑组织蛋白的抽取:
⑴ 取小鼠海马、文状体、前皮质组织 ~200mg加1ml全细胞裂解液(组织裂解液(全细胞蛋白提取):1:Tris-HCL50mmoL/L(PH7.4) 2: Nacl 150 mmoL/L 3: 去氧胆酸钠 0.25% 4:NP-40或Triton-x-100 1% 5: EDTA 1 mmoL/L 6:PMSF 1 mmoL/L 7:Aprotinin1μg/ml 8: leupeptin 1μg/ml 9: pepstain 1μg/ml),手动冰上快速匀浆。
⑵ 14000rpm离心40min
⑶ 上清即为抽取的蛋白,吸出分装,进行定量。(-20℃保存)
⑷ 将所有蛋白样品调至等浓度
电泳
制备聚丙烯酰胺凝胶:
1、  注意一定要将玻璃板洗净,最后用ddH2O冲洗,将与胶接触的一面向下倾斜置于干净的纸巾晾干。
2、  SDS-PAGE 胶的配制
15%
30%丙烯酰胺 (ml)    4.0
4 X resolving (ml)    2
ddH2O (ml)  3.87    2
10%AP (μl)   40~~~~~~~~~~~~~~80
3、  混匀后小心将分离胶注入准备好的玻璃板中,到达第一条横线。
4、  封胶
5、  待胶凝后将封胶液倒掉,如用已醇封胶
6、  配制5%浓缩胶:插入梳子,室温下放置1小时左右。
5%浓缩胶
30%丙烯酰胺 (ml) 0.35
4 X stacking (ml)  0.75
ddH2O (ml)  1.97
10%AP (μl)  20~~~~~30  
7、  灌好浓缩胶后1h拔除梳子,注意在拔除梳子时宜边加水边拔,以免有气泡进入梳孔使梳孔变形。拨出梳子后用ddH2O冲洗胶孔两遍以去除残胶,随后用0.1%的SDS封胶。若上样孔有变形,可用适当粗细的针头拨正;若变形严重,可在去除残胶后用较薄的梳子再次插入梳孔后加水拔出。30min后即可上样,长时间有利于胶结构的形成,因为肉眼观的胶凝时其内部分子的排列尚未完成。
8、  加样
1)、小心移去梳子,将凝胶电泳板放入电泳槽,用夹子夹紧,然后在上下电泳槽中分别加入电泳缓冲液(running buffer)并使上槽缓冲液浸没胶面。
2)、上样前将胶板下的气泡赶走。
3)、电泳:预电泳: 将聚合好的凝胶安置于电泳槽中,小心拔去梳子,加入电泳缓冲液后低电压10-20V的预电泳20-30min。接通电源,电压120-130V,当染料的前缘接近凝胶的底端2cm,断开电源
转膜
1、电泳结束前20分钟左右戴上手套开始准备:剪一块与胶大小一致的Hybond-P 膜,在甲醇中泡10 秒钟,再在转移buffer(transfer buffer)中浸泡10分钟,同时切下的胶也在转移buffer(transfer buffer)中浸泡一会儿然后按黑多孔板->吸水隔层-》滤纸-》胶->膜->吸水隔层->白多孔板顺序将膜和胶叠好,排尽空气,放入槽中加入冰盒,倒入转移buffer(transfer buffer)。转膜时在冰块中进行。
2、36V恒压转膜2.5小时左右。
4、膜用塑料盒装好,加入封闭液(5%脱脂奶粉+0.1%Tween20【Washing buffer】)封好盒子。室温摇床孵育30min。
5、倒掉封闭液,加入一抗(4℃过夜。(一抗用封闭液稀释)
第二天
1、  将膜用Washing buffer洗20分钟X 3。(用培养皿)
2、  将膜放入塑料盒中,加入HRP标记的-goat-anti-rabbit二抗,封好盒子。室温摇床孵育1小时。
3、  Washing buffer洗20分钟X 3。(用培养皿)
4、  PBS洗几次(用培养皿)
5、  在一保鲜膜上以1:1配制ECL,均匀滴加于膜上,作用5min,甩干膜,置于另一保鲜膜上包好显影(避光进行)。
谢谢!!
非常感谢!!
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最新回复

  • 49888 (2014-6-28 17:02:06)

    膜是0.2um的PDVF膜
  • PINK (2014-6-28 17:02:33)


    建议你的PVDF膜在甲醇中多浸泡一会,这样可以提高小分子量蛋白与膜结合的能力.
    你有没有在转膜前对目的蛋白进行SDS-PAGE后染色实验,观察过蛋白是否很好的展现在胶上?这么小的蛋白在SDS上的分辨能力很不足.
    另外转膜后的胶你也可以染色后观察蛋白是否转移走了.
  • 49888 (2014-6-28 17:02:55)

    我丽春红S染色了,但胶和膜都没看到目的蛋白条带
    我现在觉得有是否是一下问题:请高手指点。谢谢
    1、匀浆时没加Na3VO4,但我加了NaF,防止蛋白磷酸化,只加这一种有用吗?
    2、匀浆时只加了蛋白酶抑制剂,不知道是否含有PMSF ,是否对蛋白是否有影响?
    3、我加样的量是30ul,是否还少了?没有进行蛋白定量,~200mg加匀浆液1ml,后蛋白变性时加1/3的5X上样缓冲液。
    4、电泳时时间过长,因为没有含有7.5KD大小的蛋白Marker,只有最小分子量20KD的蛋白Marker,所以在溴酚兰跑到离底边5-6cm时不知道7.5KD的目的蛋白是否已经跑掉了?
    5、转膜时条件还是不知道:36v2-4h(湿转)是否合适?我觉得这步是关键。
    6、显影时一点都没有,光板,什么都没有,非特异性的条带都没有,是否能说明二抗有问题?我最多时加到1:400。
  • 49888 (2014-6-28 17:03:16)

    这么小的蛋白湿转的条件一般是多少?
  • 49888 (2014-6-28 17:03:42)

    这么小的蛋白湿转时0.2um的PDVF膜是否合适?
  • 49888 (2014-6-28 17:04:37)


    半干转膜1mA/cm2,90min相当于湿转的条件是多少?
    谢谢
  • mickeylin (2014-6-28 17:04:54)


    小分子电泳与一般大分子电泳使用的分离技术不一样,我用的是三层胶分离,由分离胶,间隙胶 和浓缩胶组成. 王旭,何冰芳 Tricine-SDS-PAGE 电泳分析小分子多肽[J] 南京:南京工业大学学报,2003,3
  • 49888 (2014-6-28 17:05:12)

    我看了这篇文章,不错
    谢谢
    但是它只有电泳方面的,没有电泳后面的过程,请问这么小的蛋白湿转的条件一般是多少?
    谢谢
    做的好苦呀,又没做出来
  • yjf1026 (2014-6-28 17:07:01)


    1.你的转膜条件不对,36v2.5小时,你的蛋白早就转过了.建议10v 20min试下
    2.甲醇泡膜时间加长为2-3min
    肯定能成功.
  • dragonkilly (2014-6-28 17:07:23)

    10v 20min??
    我丽春红S染色了,但胶和膜都没看到目的蛋白条带
    我现在觉得有是否是一下问题:请高手指点。谢谢
    1、匀浆时没加Na3VO4,但我加了NaF,防止蛋白磷酸化,只加这一种有用吗?
    2、匀浆时只加了蛋白酶抑制剂,不知道是否含有PMSF ,是否对蛋白是否有影响?
    3、我加样的量是30ul,是否还少了?没有进行蛋白定量,~200mg加匀浆液1ml,后蛋白变性时加1/3的5X上样缓冲液。
    4、电泳时时间过长,因为没有含有7.5KD大小的蛋白Marker,只有最小分子量20KD的蛋白Marker,所以在溴酚兰跑到离底边5-6cm时不知道7.5KD的目的蛋白是否已经跑掉了?
    5、转膜时条件还是不知道:36v2-4h(湿转)是否合适?我觉得这步是关键。
    6、显影时一点都没有,光板,什么都没有,非特异性的条带都没有,是否能说明二抗有问题?我最多时加到1:400。
    ......

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    现在有14KDa大小的MARKER的,我觉得有一点,你可以染半快,转半块,如果你的蛋白量很少的,那就用银染把,不过一般考马斯亮兰够了,这样你就知道你的蛋白跑出去了没,还有现在有可视MARKER,这样你可以大概在跑胶的时候就知道14左右的蛋白在哪里,
    还有你应该把你转膜完的胶去染色,这样就可以知道是不是你没有转过去,还在胶上不,至于转过了没,你可以查查膜的参数,它可以转的最小的蛋白是多少,如果小于你的蛋白,不用担心转过头了,
    还有就是用检测你的一抗和二抗了,一是否失效,二浓度是否合适,直接二抗加显色剂就可以看看是不是二抗的问题了,
    我们以前用的也是PVDF膜,太烦了,还不如NC膜,方便,怎么做都出来
    个人意见,仅供参考./color]
  • 49888 (2014-6-28 17:08:18)


    10v 20min??
    这么小呀
    我是湿转的呀
    我试试看看
    谢谢
  • DONT (2014-6-28 17:09:22)


    能不能给我申请加一分啊,我做的蛋白只有3KD,在电泳时分阴极缓冲液和阳极缓冲液,不知道你注意没有,还有其阴极缓冲液和阳极缓冲液以及胶缓冲液的PH值都有限定的,最好是周围有人指导你做,这个挺难的.
    我在转膜时用的是湿转,没有什么特别的.由于分子比较小,应比普通的转膜时间短一点.具体要慢点试,是比较难.
  • DONT (2014-6-28 17:11:26)


    还有我不知道你怎样做的,我做一次大概需要2-3天左右,而你好象一天不到就做了一次,是不是有点快了,做胶要耐心一点,配液调PH值也需要一定时间的
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