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【求助】小分子蛋白tricine-SDS 电泳只跑到分离胶的一半...
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现在做tricine电泳分离7K的蛋白,伯乐的电泳仪,10mA(40v), 1.5h,20mA(100V) 2.5h,溴酚蓝跑到胶底部,但是染色后组织蛋白只跑到分离胶的一般左右,而且溴酚蓝在浓缩胶的时候呈一条线,但是经过积层胶到电泳结束,溴酚蓝模糊成团状,但是蛋白条带是清晰的(除了最后一团块),请问这是怎么回事?请指教。
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最新回复
wu11998866 (2014-6-30 18:13:23)
如图:
94497554.snap.jpg
wu11998866 (2014-6-30 18:13:40)
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2792702_1.html')
可能的情况有:1.浓缩胶太短;2.样品浓度过太大;3.电泳的缓冲液有问题,要用新的;4.进入分离胶后的电压是否小了。5.提取蛋白时,离心速度不够。有颗粒物。
多摸素,好运!!!
说明:1,浓缩胶有1cm,2,从图上看浓度好像不大啊,3,都是新的,4,有100v,5,样品比较清亮,况且marker也没有跑下来
1、分离胶的配置是否有问题,尤其是分离胶缓冲液的pH值是否正确。
2、内外电泳槽的电泳液是否有交通:因为tricine电泳的阴极缓冲液与阳极缓冲液成分及pH不同,如果相交通,也无法跑出漂亮的结果来。
PH值准确,用的是伯乐的电泳槽,应该没有交联,
跑了几次都是这样, 不知如何是好
bamboo16 (2014-6-30 18:14:00)
样品浓度过太大
wu11998866 (2014-6-30 18:14:20)
谢谢,我稀释一下试试看看
qhyu (2014-6-30 18:14:45)
我的和你的问题差不多,小分子量的蛋白感觉都没了!
也是伯乐的槽子和电泳仪
解决了
请告诉我改进的方法
谢谢了
25186502.jpg
wu11998866 (2014-6-30 18:15:08)
将样品倍比稀释8倍,16倍,32倍,只是下面一大坨变成了一条线,约15K处,感觉地下还是光板,请问该如何解决?
wu11998866 (2014-6-30 18:22:44)
QUOTE:
按照文献,阳极缓冲液调到8.9,阴极的文献说不用调,约8.25左右,配胶还要调PH值吗?wu11998866 (2014-6-30 18:23:21)
wu11998866 (2014-6-30 18:27:14)
taoshengyijiu (2014-6-30 18:27:34)
样品浓度过高!
DONT (2014-6-30 18:27:57)
从你的条带来看,电极缓冲液应该是没有问题的。
我想问题应该主要有两方面:
1、从你的图来看,两个泳道均出现了很粗的条带,而且涨破了泳道,呈纺锤形,这说明你的蛋白浓度过大,可考虑稀释后上样,蛋白量20-50ug/孔。
2、条带存在于浓缩胶中,没跑下来,marker也没跑下来(不知道你的分子量大小是多大的),应该是胶的浓度(浓缩胶和分离胶)过大,可适当降低浓度,就可以了。
wu11998866 (2014-6-30 18:28:25)
QUOTE:
跑的是组织的蛋白,目的蛋白7K,后来做的时候已经稀释到200倍了,条带已经很浅了,但是底下那条比较粗的条带仍然停留在15K处。我先换一下缓冲液试试看
fox_79 (2014-6-30 18:28:46)
你的sample buffer怎么不用CBB-G250作指示剂呢?我现在也正在跑小分子电泳, 我的目的蛋白才4K,跑出来的结果好象还可以.起码条带很清楚.另外,在电泳时,电流千万不要太大,我在电泳时,电压加到40V,电流就有36mA,所以我就在电泳过程中,稍微对电压进行了一些调整.很多小分子胶电泳都提示要恒压(70-100),但是如果是新的电泳缓冲液会导致电流很大,应该对电压进行调整。最好不要让电流超过30mA,尤其不要超过40mA。电泳的时间确实是要长很多,我通常都要180min以上。所以现在实验室的人都怕我跑小分子了,因为我要跑上,通常要一个半天以上。我的电泳系统还没有整理好,等我整理好以后,发给你。
ritou1985 (2014-6-30 18:29:10)
我也是用CBG-G250做示综剂,溴芬兰跑得太快,不适合用于TRICINE系统
fox_79 (2014-6-30 18:29:46)
以下是我现在做的小分子电泳所用的系统,仅供参考:
30% Acrylamide-bisacrylamide mixture
29.0g acrylamide
1.0 g bisacrylamide
Add water to final volume of 100ml .Store 4°C
Anode Buffer (10x)
121.14 g Tris-base
400ml ddH2O
HCl pH8.9
Add water to final volume of 500ml .Store 4°C.
Cathode Buffer for (10x)
60.57 g Tris-base
89.6g Tricine
5.0 g SDS
Add water to final volume of 500ml
When solution is diluted to 1x, pH=8.25 .Store 4°C.
Gel Buffer
90.75 g Tris-base
200ml ddH2O
HCl pH8.45
0.75 g SDS
Add water to final volume of 250 mL.
Sample Buffer (2x)
0.5M Tris-HCl()pH6.8) 2.0ml
50% glycerol 4.8ml
10% SDS 1.0ml
2-ME(mercaptoethanol) 0.2ml
Coomassie Blue G-250 0.2mg
Add water to final volume of 10 mL. Store 4°C.
Stain Solution
50ml acetic acid
225ml methanol
225ml ddH2O
1.25g CBB R-250
Destain Solution
50ml acetic acid
225ml methanol
225ml ddH2O
Separating gel(8vml,16%)
30%acrylamide-bisacrylamide mixture(29∶1) 3.3ml
gel buffer 2.0ml
H2O 2.2ml
urea 2.16g
10% APS 100μl
TEMED 5-10μl
Stacking gel(3ml,4%)
30%acrylamide-bisacrylamide mixture(29∶1) 0.42ml
gel buffer 0.75ml
H2O 1.9ml
10% APS 50μl
TEMED 3-5μl
在电泳时,电流建议不要超过30mA,最多时间稍长一些。最好是恒压(70-100V),如果电流过大时,电压应稍做调整。记得我当时使用新的阴阳极缓冲液40V电压时,电流就高达36mA,我是降压维持在30mA以内。后面随电泳时间延长,电流下降后,稍微增加电压,200min内跑完。效果还是不错,我的目的蛋白4K,纯化后的样品。
wu11998866 (2014-6-30 18:30:13)
u234 (2014-6-30 18:30:44)
nn255 (2014-6-30 18:31:13)
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