【求助】蛋白质表达最优条件的摸索

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【求助】蛋白质表达最优条件的摸索

郁闷!我的课题刚刚开始,首先要摸索一种重组蛋白表达的最优条件,重组菌是老师给的,我按照《分子克隆》所描述进行操作:增菌到对数生长期、选择不同浓度的IPTG分组诱导,结果SDS-PAGE没有显示出我要的蛋白,老师说我的蛋白之所以没有表达是因为我用试管摇菌,应该用锥形瓶的。她的意思我明白,锥形瓶可以提供更大的细菌生长空间,可是我用试管摇菌,只有5ml的菌液,对蛋白质的表达影响不至于会这么大吧。我怀疑可能是细菌有问题。有经验的大侠请不吝赐教:蛋白质最优条件的摸索每次摇多少菌液?用试管还是锥形瓶?二者影响有多大?
心急如焚!
谢谢!
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  • qqq111 (2014-7-05 16:41:06)


    以下是我们的做法,供你参考(已经成功表达多个基因):
    1.挑单克隆放入离心管中37度摇过夜(5ml左右即可)
    2.过夜菌液按1:100稀释继续摇到对数中期(测OD值)
    3.加IPTG诱导3-4小时
    4.收集菌体,电泳.
    其中第一步用试管即可,以下的步骤建议你用锥形瓶或烧瓶,具体用多大的瓶原则上按照:所摇的液体不超过瓶体积的20%,即1000ML的烧瓶别超过200ML.摇床转速一般在200转/分以上最好.
    具体到条件的优化,最主要的是诱导时的温度(第3步),他关系到可溶性表达比例的高低,IPTG的浓度影响不是太大,因为你现在不表达,建议你用一个IPTG浓度(0.2-0.6都行)实验就行了,先确定到底表不表达,再考虑优化条件.
      当然,每个基因不同所需的表达条件也不同,最终需要你自己摸索.
    GOOD LUCK!
  • vera+ (2014-7-05 16:41:27)

    谢谢你!我诱导时用的是15ml左右的试管,50ul菌液加入5ml培养基啊
  • tie8 (2014-7-05 16:41:47)


    摇菌时瓶的底面积大小是比较重要的,试管底的面积太小了,我建议你把量做大点,反正程序是一样的,做的量少也不省事,烧瓶也就几快钱,如果还没结果估计上游出问题的可能性比较大了,基因不表达的理由可是有若干条啊,只能仔细分析了,呵呵。
  • 831226 (2014-7-05 16:42:07)


    我认为你可以自己试着摸索一下你蛋白的最优化条件,因为不同的蛋白的表达条件都是不一样的。下面说一下我的蛋白(表达菌BL21)的表达条件:
    1,将转化后的平板中挑单个菌落,放3ml培养液中37度摇过夜。
    2,按1:100取50ul加入到五支分别盛有5ml培养基的试管中,摇至OD值为600,然后分别加IPTG至终浓度分别为0.2,0.6,0.8,1.0,1.2,摇菌4小时,然后分别跑胶看表达量。
    3,然后按IPTG最优化条件,再分别按1:10,1:50,1:100,1:150,1:200,然后摇菌4小时,然后跑胶看表达量。
    4,按IPTG和取菌量最优化条件分别加IPTG分别摇1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,分别跑胶看表达量。
    经过这几个步骤你就能综合出,你蛋白表达的最优化条件,大概需要三四天的时间吧。
  • vera+ (2014-7-05 16:42:36)


    3,然后按IPTG最优化条件,再分别按1:10,1:50,1:100,1:150,1:200,然后摇菌4小时,然后跑胶看表达量。
    艳过刘痕,逆-上面所说的比例是指什么?谢谢!
  • 831226 (2014-7-05 16:42:54)

    比例就是摇菌前所加的菌量和培养液的比例
  • vera+ (2014-7-05 16:43:12)


    我又做了一轮实验,结果SDS-PAGE的结果显示的蛋白并不是我需要的分子量,我的目的蛋白分子量在21kd左右,可是电泳得到的新条带分子量在120kd附近,难道是形成包涵体了吗?还可能是什么原因?请各位有经验的老师指点迷津。
    谢谢
  • hold住 (2014-7-05 16:43:29)

    你的重组质粒的宿主菌是BL21吗?
    你可以重新提取质粒,看看菌里的质粒还在不在了,是不是在保存过程中质粒丢失了;提出的质粒可以送去测序,看看是不是你要的质粒,有没有突变;同时可以把提出的质粒重新转化一次,再做诱导表达。
    个人意见,仅供参考
  • vera+ (2014-7-05 16:43:46)


    谢谢!我只是做下游的蛋白质表达和纯化以及单抗制备,上游的工作是另一个人做的
  • hold住 (2014-7-05 16:44:04)


    你也怀疑菌有问题,总得先证明菌没有问题才能保证后面的工作有意义
  • vera+ (2014-7-05 16:44:26)


    如果不是菌种的问题,还有哪些因素会导致没有目的蛋白表达呢?
    心急如焚!希望有经验的老师赐教!
  • standbyme (2014-7-05 16:45:06)


    1诱导时的菌提浓度对他的表达量影响可能很大,,,,反正在我的实验中是这样的
    2.你可以看一下在诱导前后细菌的军体蛋白在电泳图上有无变化,,我觉得在这种图上可以大概判定基因是否转录,,也就是说估计一下是在转录还是翻译水平上出现了问题..或者是蛋白在翻译后是否被降解....
    还有设对照看加诱导剂后细菌的生长情况.等
    总之我觉得应该将各种现象观察仔细综合分析..应该是能发现一些迹象的
  • standbyme (2014-7-05 16:45:31)


    还有,,你的氧含量明显太低,,,这也是一个对表达影响很大的因素哟..我在做一个lac启动子表达时只要容氧量低于70%,,,转束低于180 温度低于35.5就无表达
    呵呵 一点感受,,别见笑
  • abc816 (2014-7-05 16:45:54)


    建议楼主给出更详细一点的信息,比如:载体名称,宿主菌。大家好帮你出谋划策!
  • jkobn (2014-7-05 16:46:18)

    我认为你可以自己试着摸索一下你蛋白的最优化条件,因为不同的蛋白的表达条件都是不一样的。下面说一下我的蛋白(表达菌BL21)的表达条件:
    1,将转化后的平板中挑单个菌落,放3ml培养液中37度摇过夜。
    2,按1:100取50ul加入到五支分别盛有5ml培养基的试管中,摇至OD值为600,然后分别加IPTG至终浓度分别为0.2,0.6,0.8,1.0,1.2,摇菌4小时,然后分别跑胶看表达量。
    3,然后按IPTG最优化条件,再分别按1:10,1:50,1:100,1:150,1:200,然后摇菌4小时,然后跑胶看表达量。
    4,按IPTG和取菌量最优化条件分别加IPTG分别摇1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,分别跑胶看表达量。
    经过这几个步骤你就能综合出,你蛋白表达的最优化条件,大概需要三四天的时间吧。
    ......

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    说错了,应该是摇到OD600=0.5
  • vera+ (2014-7-05 16:46:36)


    不好意思,我想问一下。如果空载体的表达情况很好,可是融合蛋白就是不表达,会不会也跟菌有关呢
  • PINK (2014-7-05 16:46:59)


    如果是那样,说明细菌没问题,可能是:
    1. 融合蛋白基因序列有问题,测序鉴定;
    2. 表达蛋白对载体细菌有毒性,可通过用加葡萄糖的LB来鉴定,具体方法就不写了,搜搜园子里一大堆关于表达蛋白毒性及解决方法的帖子;
    3. 换一下表达条件,摸个梯度,包括IPTG,表达时间等等。
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