【求助】 看看我的PCR跑出来为什么这样的

这是我昨天做的温度梯度pcr电泳结果图,我是扩基因,怎么会有两条带呢?我的片段长度是831bp,上游引物退火温度是62,下游引物是58.2,酶用的是KOD高保真酶,扩增40个循环,2-4孔的温度梯度分别是52.3、53.2、54.3、56.6,第一个孔是单独做了一锅53度的。。大家给点建议。。。


2012.11.28bad1梯度2.jpg


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最新回复

  • yjf1026 (2014-11-29 09:51:10)

    给你点建议,
    第一、以后把marker大小写出来,
    第二,设置梯度可以是上下游引物温度的平均值上下5度来这样设置,比如对于你的引物,可以设置为(62+58.5)/2=60.25,即55度到65度,所以说你的梯度设置有问题的
    第三、你的胶可以再跑一下,条带都没有跑开
    第四、有两条条带说明一个问题,你的引物的特异性不好。
    就这样
  • tudou85 (2014-11-29 09:51:39)

    谢谢你的建议。我的引物是2000的,曾跑过一次55度的,没出带。至于引物,我正准备重新设计一对。。再次感谢。。
  • okhaha (2014-11-29 09:53:52)

    你的条带太多,应该是引物问题,重新设计下引物吧,或者试试提高退火温度(可减少非特异性扩增)
  • join (2014-11-29 09:54:14)


    确实,把marker跑开点,引物也不好,祝你成功
  • yjf1026 (2014-11-29 09:54:28)


    引物设计有问题
  • leifengta (2014-11-29 09:54:55)


    看看你的引物  会不会扩增 目的片段里的其它部位  你可以重新设计引物   或者把2条都回收了 然后寄出去测序  挑你需要那段
  • 考拉乌拉拉 (2014-11-29 09:55:16)


    二楼分析的很有道理。重新设计一下引物吧
  • yhz1973 (2014-11-29 09:55:33)

    退火温度低了。可以尝试58℃或更高的温度梯度。如果试过后不出,可以看你扩增的片段是不是困难模板,加增效剂试试。如果还是出两条带,那你还是看看引物的设计是不是有问题,换对引物试试。
  • qqq111 (2014-11-29 09:55:58)

    非特异性扩增,引物有问题,不行就用天根的Taq plus得了,高保真酶不怎么好。
  • mingming0638 (2014-11-29 09:56:16)

    40个循环如果正常的话跑出的条带应该很亮,出现这种情况原因是多方面的,建议,先不要换引物,先把退火温度设置正确,另一个就是酶,保证他的活性高,以及没有被污染,如果还扩不出来,那就换引物吧!!!
    另一个建议,照片我们一般把点样孔放在上面!!
  • daod (2014-11-29 09:56:44)


    的确得重新设计,!
  • jujuba (2014-11-29 09:56:56)


    应该是引物浓度过高,还有胶没跑开,最后,能否把胶摆正了拍?
  • hold住 (2014-11-29 09:57:19)

    您好,你问题解决了吗?我也遇到了这样的,怎么解决啊?
  • tudou85 (2014-11-29 09:57:36)

    QUOTE:

    原帖由 hold住 于 2014-11-29 09:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    您好,你问题解决了吗?我也遇到了这样的,怎么解决啊?
    重新设计了一对引物