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目的片段是957bp,可是总是扩到另一条大约750bp大小的带,阴性对照也扩到了,郁闷呀!
左图为taq酶扩增的结果,右图为pyrobest酶扩增结果:从左到右分别为8000marker,样1,样2,水对照。
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最新回复

  • rxcc33 (2015-1-13 11:38:41)

    扩增体系有污染,可能是水、Buffer、dntp或引物
  • 966735obeng (2015-1-13 11:39:09)

    QUOTE:

    原帖由 rxcc33 于 2015-1-13 11:38 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    扩增体系有污染,可能是水、Buffer、dntp或引物
    我也是这样怀疑,引物新的,水、Buffer、dntp也换了,可是结果还这样啊,难道是引物设计的问题?可是在基因组上引物的结合位点是特异的呀。
  • 小游abc (2015-1-13 11:39:36)


    升高温度
  • eric930 (2015-1-13 11:40:39)

    可能是引物的问题 会不会是你的目的条带中央有引物结合位点 我以前也遇到这样的情况 就是中段有总是扩出小条带
    但是还要注意如果跟别人混用试剂也很麻烦不知道会出现什么结果
  • 9妖9 (2015-1-13 11:41:05)

    我也是这样怀疑,引物新的,水、Buffer、dntp也换了,可是结果还这样啊,难道是引物设计的问题?可是在基 ...

    ========================================

    那就可能是PCR的事。难不成能形成很大的引物二聚体?
  • tianmei001 (2015-1-13 11:41:22)

    特异性不够好或者是污染
    特异性问题可以靠改变引物,改变温度和巢式PCR来解决
    体系的污染除了你提到的那些以外,酶也是可能被污染的,不妨也检查下
  • panda王 (2015-1-13 11:41:39)


    关于用水也能扩出条带的问题,我个人建议你到别的实验室借枪用一下,看看还能不能扩出来了。其他的那些污染基本都不可能,只有枪在多次吸打液体尤其是PCR扩增产物用枪洗打之后很容易有一部分气溶胶存在于枪里。
    我曾经为这事非常头疼,后来发现是枪的问题。
  • ritou1985 (2015-1-13 11:41:57)


    问题是水的同样也出了,那就说明水或者能够接触水的你使用的东西有问题啊,条带的大小不对那就得看你的引物和模版了。
    但是从一二对照来说,条带准确;单从2图来看,也只是多出了水对应的那个条带,但是一号明显更浓,说明一号的污染源最多,但是这个污染源是从何而来,就得在分析了,但是应该不是水里来,因为要是在水里,只能一样;可是从一图来看,有可能是水里的。
    那么就有一个设想,你的模版或者溶解模版的溶液,或者你的枪头污染
    这只是样一样二是同一个东西来说,哎,还是自己一个一个的排除吧,把pcr所需的所有元素,每次只变一个元素,确保变的这个安全,最后找出答案。模版也得算上
  • vvmmoy (2015-1-13 11:42:31)

    换进口的PCR管,戴口罩再试一次。你这个是明显的污染。
  • gogo (2015-1-13 11:44:35)

    重新设计引物吧
  • 966735obeng (2015-1-13 11:44:58)


    谢谢大家,我把体系中的东东都换新的了,虽然还能扩到750bp的带,但明显黯淡多了,回收后可以后续实验了。
  • pou (2015-1-13 11:45:15)


    污染
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