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【求助】 PCR条件的设计
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发表于: 2015-3-10 14:21 作者: mingming0638 来源: 分析测试百科网
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【求助】 PCR条件的设计
我刚开始做pcr实验,想知道PCR变性、退火、延伸的温度条件该怎么设计,这三种温度对PCR过程或者结果会产生什么样的影响?希望前辈指点一下。
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【求助】 PCR条件的设计
我也来说两句
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dreaming
(2015-3-10 14:22:43)
变性一般94-96度,这个温度是把双链DNA打开,而退火是引物与模板结合一般55-65度,具体的温度根据你的引物的Tm值来确定,一般使用60,延伸温度是根据酶来确定的,Taq酶的最佳活性温度是72度,所以Taq酶72度延伸;而pfu高保真酶的最佳活性温度是68度,所以68度延伸
希望对你有用!
kewanqi2011
(2015-3-10 14:23:08)
可以去生物论坛上找资源 很多的 楼上说的很对
nikonun
(2015-3-10 14:23:25)
热变性的目的是将双链DNA解链为单链DNA,使在引物与模板能够退火为双链,延伸是再上面的基础上DNA Polymerase进行的聚合反应;而热变性的温度大多采用93~95℃(Taq酶在95℃的半衰期只有20min,94℃的半衰期是40min,大多数都采用94℃),在这个温度下dsDNA完全能够解链为dsDNA;退火的温度要根据引物的Tm值而定,一般采用Tm-3~5℃的温度做退火(其实Tm值仅仅是个参考,还和引物的结构有关);延伸温度是由你使用的聚合酶而定,普通的Taq酶的话就用72℃就可以了。
希望对你有所帮助!
49888
(2015-3-10 14:23:44)
主要是退火温度和延伸时间,退火温度有引物决定,延伸时间由扩增片段大小决定
[
本帖最后由 49888 于 2015-3-10 14:25 编辑
]
u234
(2015-3-10 14:25:56)
变的只有两个嘛。。。退火温度(比Tm小5°),二是延伸时间(据说按照1000bp:1分钟这个比例计算),,,,其他都基本一样滴啦~~如果你不知道引物对应的退火温度,需要探索,建议温度梯度PCR,来探索最佳条件~~
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【求助】 PCR条件的设计
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dreaming (2015-3-10 14:22:43)
变性一般94-96度,这个温度是把双链DNA打开,而退火是引物与模板结合一般55-65度,具体的温度根据你的引物的Tm值来确定,一般使用60,延伸温度是根据酶来确定的,Taq酶的最佳活性温度是72度,所以Taq酶72度延伸;而pfu高保真酶的最佳活性温度是68度,所以68度延伸
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kewanqi2011 (2015-3-10 14:23:08)
nikonun (2015-3-10 14:23:25)
热变性的目的是将双链DNA解链为单链DNA,使在引物与模板能够退火为双链,延伸是再上面的基础上DNA Polymerase进行的聚合反应;而热变性的温度大多采用93~95℃(Taq酶在95℃的半衰期只有20min,94℃的半衰期是40min,大多数都采用94℃),在这个温度下dsDNA完全能够解链为dsDNA;退火的温度要根据引物的Tm值而定,一般采用Tm-3~5℃的温度做退火(其实Tm值仅仅是个参考,还和引物的结构有关);延伸温度是由你使用的聚合酶而定,普通的Taq酶的话就用72℃就可以了。
希望对你有所帮助!
49888 (2015-3-10 14:23:44)
[ 本帖最后由 49888 于 2015-3-10 14:25 编辑 ]
u234 (2015-3-10 14:25:56)
【求助】 PCR条件的设计