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【求助】请大家帮忙看看怎样来优化pcr体系
最近要做DNA回收~一直在做体系的优化~想减少一些杂带和引物二聚体~【求助】请大家帮忙看看怎样来优化pcr体系
这是今天我做的pcr电泳图
大致信息如下:
mark:D2000
3种引物都是简并引物
DNA模板相同
退火温度是筛选过的
体系都是:50ul
MIX:25ul
primer1:2.5ul
primer2: 2.5ul
ddH2O: 17.5ul
teaplate: 2.5ul
上左图:PCR扩怎程序大致为:
94℃——5min
·························
94℃——40s
60℃——40s ×35循环
72℃——1.5min
··························
72℃——10min
上右图:PCR扩怎程序大致为:
94℃——5min
·························
94℃——40s
55℃——40s ×35循环
72℃——1.5min
··························
72℃——5min
下图:PCR扩怎程序大致为:
94℃——5min
·························
94℃——40s
60℃——40s ×35循环
72℃——1.5min
··························
72℃——10min
之前做过10ul体系 效果还可以 杂带和引物二聚体都很少
体系:5ul
MIX:0.5ul
primer1:0.5ul
primer2: 0.5ul
ddH2O: 3.5ul
teaplate: 0.5ul
要回收DNA~所以我把体系加到50ul~其实就是将10ul体系乘以5 结果 出现了很多杂带和引物二聚体 我要怎么调整 体系或者是pcr过程来减少杂带和引物二聚体 而使我要的DNA片段比较亮?请各位高手指点一下!O(∩_∩)O谢谢
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在在 2012-05-04 16hr 29min.GIF
最新回复
one (2015-3-11 16:24:01)
有没有试过加BSA或者提高退火温度
或者进行2次PCR,得到的条带应该会比较纯
轰轰 (2015-3-11 16:24:17)
eor (2015-3-11 16:24:33)
体系虽然加倍,但并不是所有的试剂加倍就行,引物没必要加倍,不然二聚体现象会严重。模版浓度是多少?
lgm (2015-3-11 16:24:50)
yapuyapu (2015-3-11 16:25:07)
jingling845 (2015-3-11 16:25:22)
降低体系中的Mg离子浓度
土壤 (2015-3-11 16:25:54)
来个巢式PCR吧!
TAT (2015-3-11 16:26:10)
用spss做个多因素的正交设计,全面优化条件
daod (2015-3-11 16:26:29)
66小飞侠 (2015-3-11 16:26:45)
66小飞侠 (2015-3-11 16:27:03)
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DMSO可以起什么作用 量要加多少
ququer787 (2015-3-11 16:27:22)
kuaizige (2015-3-11 16:27:37)
如果是1.5kb ,那就把延伸时间改为1min30s,循环数30,引物终浓度为10uM;
做一次试试看
DMSO的加入是特异性更强,终浓度为4-6%的样子就可以了
duoduo (2015-3-11 16:27:59)
或者进行2次PCR,得到的条带应该会比较纯
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请问一下,BSA或DMSO在25微升体系中大概加多少量?谢谢
PCR (2015-3-11 16:28:21)
QUOTE:
我一般加BSA,我加的BSA的量跟引物的量一样。DMSO要自己摸索,不同的量对PCR的扩增有不同的作用。【求助】请大家帮忙看看怎样来优化pcr体系