【求助】如何寻找某个基因序列的糖基化位点

最新回复

• duoduo (2016-2-29 10:40:07)

  
  氮糖基化的规律：出现N-X-T/S序列可以认定是氮糖基化位点。X代表任意氨基酸。
  氧糖基化迄今尚无规律可循。

• fangxiang (2016-2-29 10:40:27)

  
  首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
  如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点，可以到如下网站去在线预测：
  1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian proteins
  cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/')
  2.NetNGlyc - Prediction of N-glycosylation sites in human proteins
  cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/')
  3.YinOYang - O-beta-GlcNAc attachment sites in eukaryotic protein sequences
  cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/')

• 555444 (2016-2-29 10:40:48)

  
  我是一新手，我想问一下，糖基化位点又意味着什么？？？多谢！！

• 薄荷侠 (2016-2-29 10:41:18)

  QUOTE:

  原帖由 fangxiang 于 2016-2-29 10:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  
  首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
  如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点，可以到如下网站去在线预测：
  1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian pro ...

  我是一位新手，我试了一下，但有些弄不懂！！请赐教！！多谢！！

• 薄荷侠 (2016-2-29 10:43:56)

  QUOTE:

  原帖由 fangxiang 于 2016-2-29 10:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  
  首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
  如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点，可以到如下网站去在线预测：
  1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian pro ...

  但是我测了一个基因序列，没有完整的ORF，不能翻译成完整的氨基酸。请帮忙！！

• 薄荷侠 (2016-2-29 10:58:30)

  
  请问yioyang中的yinyang代表什么？？多谢！！